Le Musée copte a été construit en 1910 pour y conserver la collection d'art copte. Unique en Egypte elle est la plus importante du monde. Le musée a été rénové en 1984. Le christianisme s'est répandu en Egypte au deuxième siècle et a été la religion principale jusqu'à l'arrivée en 641 de l'Islam. 16 000 objets sont exposés par ordre chronologique, pour permettre de suivre les périodes historiques et l'évolution de l'art sous les diverses influences : la période romaine, byzantine puis l'influence musulmane plus tardive. La collection comprend des objets de pierre comme des colonnes, des chapiteaux, des tombes, des frontons, des stèles et des frises. Elle contient par ailleurs des trésors provenant de monastères et d'églises comme des icônes, de l'ivoire, des os gravés, des objets en métal, des instruments de musique liturgique ainsi que des bijoux et des produits cosmétiques, des objets quotidiens, des objets en bois, des textiles et des manuscrits.