Consacré en priorité au dieu-bélier Khnoum, le temple d' Esna remonte à l'époque gréco-romaine. La seule partie visible en est la salle hypostyle. Il faut effectuer une descente de neuf mètres pour atteindre son pavement. En effet, la ville moderne s'est développée sur les ruines de l'antique cité, et le toit du temple est au niveau du sol des maisons actuelles.
Comme pour la majorité des autres temples gréco-romains d'Egypte, plusieurs souverains ont participé à sa construction. Les premières inscriptions remontent à Ptolémée VI Philométor et Ptolémée VIII Evergéte II (145 av. J.-C.). La salle hypostyle date du premier siècle de notre ére (bâtie par les empereurs romains Claude et Vespasien). Trajan et Hadrien sont également mentionnés. Les textes les plus récents, considérés comme les dernières inscriptions écrites en caractères hiéroglyphiques, sont du milieu du troisième siècle. Divers textes donnent la version locale du mythe de création de l'humanité par le dieu Khnoum. D'autres décrivent les fêtes annuelles célébrées dans le temple. Soutenu par vingt-quatre colonnes entièrement recouvertes d'hiéroglyphes et surmontées d'un chapiteau composite à motif floral, le plafond de la salle hypostyle est décoré de thèmes astronomiques et de vautours aux ailes déployées.